Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rdh11Q9QYF1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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