Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Copg2Q9QXK3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms