Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crlf1Q9JM58 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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