Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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