Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CtsmQ9JL96 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtsmQ9JL96 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms