Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms