Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms