Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms