Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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