Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms