Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn2Q9ER65 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms