Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhox9Q9EQM5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms