Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms