Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Syde1Q9DBZ9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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