Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms