Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem239Q9DA47 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms