Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg7Q9D906 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms