Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tvp23bQ9D8T4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tvp23bQ9D8T4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tvp23bQ9D8T4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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