Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms