Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmigd1Q9D7L8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms