Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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