Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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