Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms