Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc7Q9D541 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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