Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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