Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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