Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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