Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D2Q3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D2Q3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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