Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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