Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms