Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Susd3Q9D176 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd3Q9D176 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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