Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem88Q9D0N8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem88Q9D0N8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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