Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms