Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms