Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms