Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms