Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snw1Q9CSN1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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