Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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