Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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