Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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