Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim26Q99PN3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms