Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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