Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl3Q99N95 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms