Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hdac9Q99N13 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms