Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms