Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lactb2Q99KR3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms