Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms