Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms