Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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