Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms